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基于高通量测序探究芒硝用于肠道准备对菌群的影响

戴鹏辉  夏洪芬  唐凤  甘轲  朱娅  邓明明  
【摘要】:目的探究芒硝用于肠道准备对菌群丰度及多样性影响。方法共招募10名来自西南医科大学的健康受试者,收集其肠道准备前一天成型便、服用芒硝肠道准备后第一次成型便及肠道准备后第14 d的成型粪便标本,分别记为肠道准备前、肠道准备后及肠道准备14 d;提取粪便微生物DNA后对16SrRNAV3~V4区段扩增并进行高通量测序,对测序原始结果进行质控、拼接、操作分类单元(OTUs)聚类后进行后续生物信息学分析;荧光定量PCR测定各样本16SrRNA载量。结果与肠道准备前比较,肠道准备后、肠道准备14 d的菌群α多样性(Chao、Shannon、Simpson指数)、β多样性略有变化,但差异无统计学意义(P 0.05)。基于97%的相似性进行物种注释并对肠道准备前、后及肠道准备14 d的粪便样本进行微生物物种丰度比较,在门水平上,厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)及拟杆菌门(Bacteroidetes)丰度有少许变化,差异无统计学意义(P 0.05);在属水平上(丰度 0.05%),肠道准备后梭菌属(Clostridium)显著减少,而内脏拟杆菌属(Odoribacter)明显增多,差异均具有统计学意义(P 0.05),而肠道准备14 d基本恢复至基线水平;链球菌属(Streptococcus)、拟杆菌属(Bacteroides)丰度有少许变化,差异无统计学意义(P 0.05)。荧光定量PCR结果表明,肠道准备前、后及肠道准备14 d的菌群总量基本持平,差异无统计学意义(P 0.05)。结论芒硝作为一种天然矿物药用于肠道准备对菌群丰度及多样性影响不大。

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